２００３年１２月１４日からオーストリア航空、ルフトハンザ航空、ＳＡＳなどスター・アライアンス加盟の航空会社を利用する場合、「ウィーンミッテ駅」の新しいチェックインホールにて搭乗手続きができるようになりました。
特にシティ・エアポート・トレインの利用者は、出発の２４時間前からチェックインができます。

有人チェックインカウンターが４箇所、自動チェックインカウンターが８箇所設置されています。買い物をした商品の付加価値税払い戻し手続きのために税関のカウンターも１箇所、また航空券販売カウンター、ＣＡＴチケットの自動販売機もあります。

ウィーン市内で搭乗手続きができるようになり、観光客も重い荷物を空港まで運ぶことなく大変便利になりました。